El 3 de julio de 1906 se crea la Facultad Nacional de Ingeniería con el nombre de Escuela de Minas a fin de cubrir los requerimientos en formación de recursos humanos necesarios para la industria minera del país que en ese entonces se constituye en el pilar más importante de la economía del Estado. Durante la Guerra del Chaco, en junio de 1932, la Escuela de Minas interrumpe sus labores académicas a partir de la gestión 1933 y en el lapso de 1933-1935, su local fue utilizado como Hospital Militar.

Mediante Resolución de 11 de enero de 1939, fue creada la Facultad de Ciencias Económicas, durante la gestión rectoral del Dr. Francisco Fajardo, siendo el primer Director de la Facultad el Dr. Josermo Murillo Vacarreza; fijando posteriormente el Honorable Consejo Universitario, la fecha de fundación oficial de la Facultad el 25 de octubre.

La Facultad Técnica fue fundada el 18 de marzo de 1940, por el Dr. Francisco Fajardo, entonces Rector de la Universidad Técnica de Oruro, para el consiguiente funcionamiento normal se aprueba un plan de organización mediante una Resolución del Honorable Consejo Universitario pág. 89 presentada por el Dr. Josermo Murillo Vacárreza pidiendo la formulación de programas, la designación de catedráticos y para su infraestructura se adquiere, 30.000 m2, de terreno con fondos departamentales.

En fecha 13 de mayo de 1983, el Honorable Consejo Universitario, emitió la Resolución de creación de la actual Facultad, teniendo como base la Carrera de Agronomía que fue creada en 1953; posteriormente es creado el Instituto Superior Agropecuario con sede en Challapata y que fue inaugurado el 23 de marzo de 1993, destinado a formar profesionales a nivel de Técnico Superior en Agropecuaria, hasta el año 1998.